瘴疫通常指的是恶性疟疾，这是一种由疟原虫引起的传染病，主要通过传疟按蚊传播。在古代中国，特别是在南方地区，由于湿热的环境，容易产生瘴气，而瘴气是导致瘴疫和疟疾的主要病因。瘴疫这一术语在历史上被用来描述由瘴气引起的多种疾病，其中最为常见的是恶性疟疾。
在古代文献中，如《后汉书》等，有关于瘴疫的记载，说明了当时人们对这种疾病的认识和应对方式。在现代，随着医学的发展，这种疾病已经有了更准确的诊断和治疗方法。
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